把生命能力从个体中解耦为可复用模块，用软件工程范式重构生命系统。
湿件工程（Wetware Engineering）是一个跨学科方法论框架，旨在将软件工程的核心抽象——模块化、接口标准化、依赖管理、运行时编排——系统性地迁移到生物系统构建领域。
这不是"用软件运行生物"，而是用编程范式重构生命系统：
- 将器官、组织、执行器、传感器视为可组合的"生物组件"（Bio-Component）
- 定义标准化接口（Bio-Interface）实现组件间的即插即用
- 使用领域特定语言（Bio-DSL）声明式描述系统组合
- 通过运行时系统（Bio-Runtime）进行资源调度和监控
- 组织工程与器官芯片研究
- 生物混合机器人开发
- 合成生物学系统设计
- 再生医学与器官替代
- 跨学科生物系统教育
| 特性 | 说明 |
|---|---|
| Bio-Component Spec | 标准化生物模块描述规范（v0.1） |
| Bio-DSL | 声明式系统组合语言 |
| Component-Interface-Runtime 三元组 | 模块化生物系统的基础抽象 |
| 中英双语文档 | 完整的概念、宣言、技术规范文档 |
| 学术论文 | 13页 arXiv 格式预印本 |
- Git
- Markdown 阅读器（VS Code、Typora 等）
- （可选）Node.js 18+（用于 Markdown lint）
- （可选）TeX Live（用于编译论文）
# 克隆仓库
git clone https://github.com/tukuaiai/wetware-engineering.git
cd wetware-engineering
# 查看文档结构
ls -la i18n/zh/
ls -la i18n/en/推荐阅读顺序：
// 定义组件
COMPONENT muscle FROM "muscle-actuator-human-skeletal@^2.3"
COMPONENT sensor FROM "piezo-force-sensor@~1.1"
COMPONENT controller FROM "neural-organoid-spinal@>=0.8"
// 连接组件
CONNECT sensor.output TO controller.input
CONNECT controller.output TO muscle.stimulation
// 运行时配置
RUNTIME {
perfusion: { temperature: 37 C, flow_rate: 0.5 mL/min },
control: { mode: "closed_loop" }
}
| 中文 | English | 说明 |
|---|---|---|
| 快速入门指南 | Quick Start | 5分钟理解核心概念 |
| 傻子博士解读版本 | - | 大白话版本，零门槛理解 |
| 湿件工程 | Wetware Engineering | 完整概念介绍 |
| 湿件工程宣言 | Manifesto | 愿景与原则 |
| 技术规范 | Technical Spec | Bio-Component Spec & Bio-DSL |
| 中文 | English | 说明 |
|---|---|---|
| 项目概述 | Overview | 项目介绍 |
| Human 3.0 架构 | Architecture | 技术架构 |
| 27要素 | 27 Elements | 永生27要素 |
| 技术蓝图 | Blueprint | 实施路线 |
| 文档 | 说明 |
|---|---|
| 预印本 PDF | 完整论文（13页，arXiv 格式） |
| LaTeX 源码 | 用于 arXiv 投稿 |
| Markdown 草稿 | 完整草稿（约9000词） |
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│ Wetware Engineering │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│ Component │ Interface │ Runtime │
│ (生物模块) │ (生物接口) │ (编排系统) │
├───────────────────┼─────────────────┼───────────────────┤
│ • Actuator 执行器 │ • Power 供能 │ • Scheduling │
│ • Sensor 传感器 │ • Signal 信号 │ • Resource Mgmt │
│ • Processor 处理器│ • Isolation 隔离│ • Monitoring │
│ • Metabolic 代谢 │ • Mechanical 机械│ • Fault Isolation│
└───────────────────┴─────────────────┴───────────────────┘
| 软件工程 | 湿件工程 | 说明 |
|---|---|---|
| Package Manager | Bio-Registry | 组件注册与发现 |
| Semantic Versioning | Bio-Versioning | [email protected] |
| API Contract | Bio-Interface | 输入/输出规范 |
| Unit Test | Viability Test | 组件功能验证 |
| Container | Perfusion System | 生命支持环境 |
wetware-engineering/
├── README.md # 本文件 - 项目主页
├── AGENTS.md # AI Agent 操作手册
├── Makefile # 常用命令（lint/paper/clean/backup）
├── metadata.yaml # 项目元数据
├── LICENSE # CC BY-SA 4.0 许可证
├── CONTRIBUTING.md # 贡献指南
├── CODE_OF_CONDUCT.md # 行为准则
│
├── i18n/ # 国际化文档
│ ├── zh/ # 中文文档
│ │ ├── README.md # 中文索引
│ │ ├── 湿件工程.md # 核心概念
│ │ ├── 湿件工程宣言.md # 宣言
│ │ ├── 湿件工程技术规范.md # 技术规范
│ │ ├── 湿件工程快速入门指南.md # 快速入门
│ │ └── src/immortality/ # 永生计划（中文）
│ │ ├── README.md
│ │ ├── docs/core/ # 核心文档
│ │ ├── docs/philosophy/ # 哲学探讨
│ │ └── docs/guides/ # 指南
│ │
│ └── en/ # English docs
│ ├── README.md
│ ├── wetware_engineering.md
│ ├── wetware_engineering_manifesto.md
│ ├── wetware_engineering_technical_spec.md
│ ├── wetware_engineering_quick_start.md
│ └── src/immortality/ # Immortality Project
│
├── paper/ # 学术论文
│ ├── arxiv/ # arXiv 投稿版本
│ │ ├── wetware_engineering.tex # LaTeX 源码
│ │ ├── wetware_engineering.pdf # 编译后 PDF（13页）
│ │ ├── arxiv.sty # arXiv 样式文件
│ │ └── orcid.pdf # ORCID 图标
│ ├── sections/ # 论文章节（Markdown）
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│
└── .github/
├── workflows/lint.yml # Markdown lint CI
├── ISSUE_TEMPLATE/ # Issue 模板
│ ├── bug_report.md
│ └── feature_request.md
└── PULL_REQUEST_TEMPLATE.md # PR 模板
| 命令 | 说明 |
|---|---|
find i18n -name "*.md" |
列出所有文档文件 |
npx markdownlint-cli2 "**/*.md" |
检查 Markdown 格式 |
cd paper/arxiv && xelatex wetware_engineering.tex |
编译 LaTeX 论文 |
python backups/快速备份.py |
执行项目备份 |
- 核心概念定义
- Bio-Component Spec v0.1 草案
- Bio-DSL 语法草案
- 中文文档（完整）
- 英文文档（完整）
- 永生计划文档（中英双语）
- 学术论文预印本（13页）
- arXiv 投稿
- 参考实现（Python/TypeScript）
- Bio-DSL 解析器
- 组件注册中心原型
- 可视化编辑器
我们欢迎各种形式的贡献！
- 文档改进：修复错误、改进表述、添加示例
- 翻译：帮助翻译到其他语言
- 概念讨论：在 Issues 中提出想法和建议
- 技术实现：参与参考实现开发
# 1. Fork 仓库
# 2. 创建分支
git checkout -b docs/your-improvement
# 3. 进行修改并提交
git commit -m "docs: your description"
# 4. 推送并创建 PR
git push origin docs/your-improvement详见 CONTRIBUTING.md。
A: 合成生物学主要在基因/分子层面操作（如 BioBricks），湿件工程在器官/系统层面操作。两者是互补的：合成生物学定义组件内部，湿件工程定义组件如何组合。
A: 目前 Bio-DSL 是概念性规范，尚无运行时实现。它的价值在于提供标准化的系统描述语言，为未来的工具链奠定基础。
A: 短期目标是建立概念框架和标准规范；中期目标是开发工具链；长期目标是实现可复用、可组合的生物系统工程。
本项目采用 CC BY-SA 4.0 许可证。
- ✅ 可自由分享和改编
- ✅ 需注明出处
- ✅ 需以相同许可证分享
- GitHub: https://github.com/tukuaiai/wetware-engineering
- 作者 ORCID: 0009-0009-6523-1823
- ZRead AI: zread.ai/tukuaiai/wetware-engineering - AI 驱动的仓库解读
- NotebookLM: Google NotebookLM 笔记本 - AI 辅助学习笔记
湿件工程：编程生命系统的未来 🧬💻