Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

- _ -

• _init_alphabet() : CawalignSimpleScores

- a -

• aConfig() : ConfigParser
• aConfigVec() : ConfigParser
• appendBuffer() : StringBuffer
• appendChar() : StringBuffer
• appendValue() : Vector, VectorFP
• appendValues() : VectorFP
• appendVector() : Vector
• args_t() : argparse::args_t

- c -

• CawalignCodonScores() : CawalignCodonScores
• CawalignSimpleScores() : CawalignSimpleScores
• ConfigParser() : ConfigParser

- e -

• extractMin() : Vector

- f -

• flip() : StringBuffer

- n -

• nucleotide_diff() : CawalignCodonScores

- r -

• remove() : Vector
• resetString() : StringBuffer
• resetVector() : Vector

- s -

• sort() : Vector
• storeValue() : Vector, VectorFP
• storeVector() : Vector
• StringBuffer() : StringBuffer
• swap() : StringBuffer, Vector

- v -

• value() : Vector
• Vector() : Vector
• VectorFP() : VectorFP

- ~ -

• ~args_t() : argparse::args_t
• ~StringBuffer() : StringBuffer
• ~Vector() : Vector
• ~VectorFP() : VectorFP