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GiulioRiggio/UMAP-R

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Il repository contiene gli algortimi sviluppati in R, ed i datasets utilizzati.
Gli scripts sono stati gestiti tramite Git e GitHub. Le linee guida generale per l’organizzazione del progetto computazionale e per la scrittura del diario scientifico sono quelle degli articoli $${\color{green} A\ Quick\ Guide\ to\ Organizing\ Computational\ Biology\ Projects}$$ e $${\color{green} Ten\ simple\ rules\ for\ a\ computational\ biologist’s\ laboratory\ notebook}$$.

The files mammoth_3d_50k.json and mammoth_3d.json were downloaded from https://github.com/PAIR-code/understanding-umap

Esempio sequenza di lancio:
File "2024-06-07 Neuroblastoma.R" inizia l'analisi del neuroblastoma, dataset 10_7717_peerj_5665_dataYM2018_neuroblastoma.csv
File "2024-05-30 tabella medie.R" crea il df statistiche
File "2024-05-30 tabelle colorate.R" crea la tabella a partire dal df statistiche
File "2024-05-31 tabella minimi.R" crea il df statistiche
File "2024-05-30 tabelle colorate.R" crea la tabella a partire dal df statistiche
File "2024-05-31 tabella massimi.R" crea il df statistiche
File "2024-05-30 tabelle colorate.R" crea la tabella a partire dal df statistiche
File "2024-06-07 Partizionamento Neuroblastoma.R" partiziono il dataset in base alle caratteristiche comuni evidenziate che osservo nelle 3 tabelle

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