RhoFold 项目 - RNA 结构预测与分析工具

基于深度学习的 RNA 三维结构预测项目，支持训练、推理和微调功能。

• 训练: 使用 train.py 训练模型
• 推理: 使用 inference_diffold.py 或 inference_rf.py 进行结构预测
• 微调: 使用 finetune.py 对预训练模型进行微调
• 批量推理: 使用 batch_inference_rhofold.py 进行批量预测

• Python >= 3.10
• PyTorch >= 1.12.0
• OpenMM >= 7.7.0
• 其他依赖见 pyproject.toml

# 使用 uv 安装依赖
uv sync

# 训练
uv run train.py

# 推理
uv run inference_diffold.py

# 微调
uv run finetune.py

见 LICENSE 文件