Ten plik uruchamiany jest poniższą komendą wpisywaną w terminalu w VS Code: python nw.py sekwencje.fa gdzie nw.py jest nazwą pliku z kodem w języku python, a plik sekwencje.fa jest plikiem zawierającym 2 sekwencje w formacie fasta. Jeżeli plik nie zawiera 2 sekwencji program zwróci informację o błedzie - plik musi zawierać 2 sekwencje. Utworzony zostaje pik wynikowy o nazwie alignment_result.txt który przechowuje informacje o wyniku dopasowania. Przykładowa zawartość pliku wejściowego: > informacje o sekwencji ADADGDGDADADCCCGAGGGGADADACCCAD > informacje o sekwencji ADDAGGGCCACACDCDCAGAGDCDCAAAADCAGDDA Oczekiwany wynik: A D D A G G G C C A C A - C D C D | | * * | * | * | * | | * | * A D A D G D G D - A D A D C C C G Score = -3 gdzie "|" oznacza "match", a "*" oznacza "mismatch".