miRNAseq_2018_workshop

CHSLab 2018年度課程區 時間表

上課日期	星期	時間	時數
3/7	三	19:00-22:00	3小時	Clear
3/10	六	17:30-20:00	2.5小時	hackmdLink
3/11	日	15:00-17:30	2.5小時	上半
3/11	日	19:00-21:00	2小時	下半

課程規劃

• 背景知識補充與名詞定義 <3/7>
• 目前運作流程 (如何啟動一個專案) <3/7>
• linux 環境 <3/10>
• conda 使用方法 <3/10>
• 安裝對應工具 <3/10>

1. fastqc (HW01)
2. fastx-toolkit (conda)
3. cutadapt (conda)
4. miRDeep2 (bowtie) (conda)

• 執行分析流程 <3/11>

• 表現量定量方法 <3/11>
• 差異表現計算方法 <3/11>
• 視覺化與報告撰寫 <3/11>