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YellowGangneng
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@YellowGangneng YellowGangneng commented Jan 8, 2025

[2025/01/08]

  • DONE
    • Overview 작성 완료했습니다.
    • pyalex를 이용해 JSON 데이터를 다운로드하고, 해당 JSON 데이터를 Neo4J에 삽입하는 코드를 추가하였습니다.
    • LangchainGraphCypherQAChainNeo4jGraph를 이용해 아주 간단한 GraphRAG 구현을 완료하였습니다.
  • TODO
    • pyalex 데이터 구성을 더 분석하여 Node 및 Relationship을 좀 더 효용성있게 구성할 예정입니다.
    • 전반적으로 코드를 깔끔하게 정리할 예정입니다.
    • 각 코드마다 Description 추가 예정입니다.

GraphDB도 처음 써보고 pyalex도 처음 접하는 데이터셋이라 파악하는데 시간이 조금 오래 걸려 완성도가 심히 떨어집니다...ㅠㅠ 빠른 시일 내에 업데이트할 수 있도록 하겠습니다!!!!


[2025/01/16]

  • DONE
    • Docker를 이용해 neo4j 컨테이너를 띄우는 작업이 필요함을 안내하였습니다.
    • pyalex를 좀 더 상세히 분석해 노드 및 관계에 대한 설정을 달리 하였고, 이에 대한 부연 설명을 추가하였습니다.
    • 각종 참고 이미지 및 URL을 추가하였습니다.
    • Langgraph를 이용해 Semantic Search 후에 답변을 생성하는 chain을 만들었습니다.
  • ISSUE
    • Langgraph에 대한 숙련도가 미숙하여 사실 구성한 그래프가 원하는 바대로 작동하지 않습니다... 그런데 어떻게 그래프를 구성해야 할 지 도저히 감이 오질 않습니다. 제대로 실행되지 않는다고 하면, 차라리 제외하는 게 나을까 싶기도 합니다.. 조금 더 구조를 고민해보고 개선해야 할 듯 싶습니다.

Author Checklist

  • PR Title Format: I have confirmed that the PR title follows the correct format. (e.g., [N-2] 07-Text Splitter / 07-RecursiveCharacterTextSplitter)

  • Committed Files: I have ensured that no unnecessary files (e.g., .bin, .gitignore, poetry.lock, pyproject.toml) are included. These files are not allowed.

  • (Optional) Related Issue: If this PR is linked to an issue, I have referenced the issue number in the PR message. (e.g., Fixes Update 01-PromptTemplate.ipynb #123)

  • ❌ Do not include unnecessary files (e.g., .bin, .gitignore, poetry.lock, pyproject.toml) or other people's code. If included, close the PR and create a new PR.

Review Template (Intial PR)

🖥️ OS: Win/Mac/Linux   
✅ Checklist      
 - [ ] **Template**: Tutorials follows the required template. 
 - [ ] **Table of Contents(TOC) Links**: All Table of Contents links work. ((Yes/No)
 - [ ] **Image**: Image filenames follow guidelines.
 - [ ] **Imports*: All import statements use the latest versions. Ensure "langchain-teddynote" is not used. 
 - [ ] **Code Execution**: Code runs without errors.
 - Comments: {Write freely, 한국어 기술 가능}     

If no one reviews your PR within a few days, please @-mention one of teddylee777, musangk, BAEM1N

@YellowGangneng YellowGangneng self-assigned this Jan 8, 2025
@YellowGangneng YellowGangneng changed the title [N-2] 04-GraphRAG / 07-Academic Search System Draft Code commit [N-1] 04-GraphRAG / 07-Academic Search System Draft Code commit Jan 8, 2025
@YellowGangneng YellowGangneng changed the title [N-1] 04-GraphRAG / 07-Academic Search System Draft Code commit [N-1] 04-GraphRAG / 07-Academic Search System Jan 8, 2025
@YellowGangneng YellowGangneng changed the title [N-1] 04-GraphRAG / 07-Academic Search System [N-1] 04-GraphRAG / 07-AcademicSearchSystem Jan 8, 2025
@YellowGangneng YellowGangneng requested review from syshin0116 and removed request for Taylor0819 January 8, 2025 14:43
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@syshin0116 syshin0116 left a comment

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생각나는대로 냅다 다 적겠습니다ㅎㅎ가벼운 마음으로 고려해주시면 감사하겠습니다!

1. Overview

  1. 설명해야할 내용이 너무 많은 주제라 고민이 많으셨을것 같아요. 핵심만 잘 정리중이신 느낌이라 좋지만 Knowledge Graph와 같이 중요하지만 한마디로 설명하기엔 너무 복잡한 내용은 잘 설명된 곳으로 링크 보내면 좀 더 친절한 글이 될 것 같습니다

  2. GraphRAG의 장점을 잘 설명해주셨는데, 구축 난이도와 같은 단점은? 이라는 생각이 일부러 안넣으신건가? 라는 생각과 함께 들었습니다.

2. Environment Setup:

사소하지만, !pip install 임시방편 부분들 공통부분에 넣으면 되는걸로 알고있습니다ㅎ

# Install required packages
from langchain_opentutorial import package

package.install(
    [
        "langchain-neo4j",
        "pyalex"
    ],
    verbose=False,
    upgrade=False,
)

3. 데이터

  1. 노드에 대한 설명은 잘 해주셨으나, 엣지는 어떻게 구성되어있는지 한번에 볼 수 있는 그림이 있으면 좋을것 같다는 생각이 들었습니다.

  2. json 파일 내용도 어떻게 구성되어있는지 살짝 보여주시면 좋을것 같습니다.

4. 실행 코드

마지막에서 두번째 셀

chain = GraphCypherQAChain.from_llm(
    llm, graph=graph, verbose=True, qa_prompt=CYPHER_QA_PROMPT, cypher_prompt=CYPHER_GENERATION_PROMPT,
    allow_dangerous_requests = True
)

마지막에서 두 번째 셀의 from_llm 부분은 현재 방식이 오래된 것 같습니다.

예전(3~4개월 전) 기준으로는 LangChain이 해당 클래스를 업데이트하지 않았던 것으로 기억하는데, 최신 상태에서도 그대로인지 살짝 확인해보시면 좋을 것 같습니다.


완전 초안이고, 생각나는 대로 마구잡이로 적어본 내용이라 가볍게 참고만 해주시면 좋겠습니다! 고생하셨습니다!

@YellowGangneng
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생각나는대로 냅다 다 적겠습니다ㅎㅎ가벼운 마음으로 고려해주시면 감사하겠습니다!

1. Overview

  1. 설명해야할 내용이 너무 많은 주제라 고민이 많으셨을것 같아요. 핵심만 잘 정리중이신 느낌이라 좋지만 Knowledge Graph와 같이 중요하지만 한마디로 설명하기엔 너무 복잡한 내용은 잘 설명된 곳으로 링크 보내면 좀 더 친절한 글이 될 것 같습니다
  2. GraphRAG의 장점을 잘 설명해주셨는데, 구축 난이도와 같은 단점은? 이라는 생각이 일부러 안넣으신건가? 라는 생각과 함께 들었습니다.

2. Environment Setup:

사소하지만, !pip install 임시방편 부분들 공통부분에 넣으면 되는걸로 알고있습니다ㅎ

# Install required packages
from langchain_opentutorial import package

package.install(
    [
        "langchain-neo4j",
        "pyalex"
    ],
    verbose=False,
    upgrade=False,
)

3. 데이터

  1. 노드에 대한 설명은 잘 해주셨으나, 엣지는 어떻게 구성되어있는지 한번에 볼 수 있는 그림이 있으면 좋을것 같다는 생각이 들었습니다.
  2. json 파일 내용도 어떻게 구성되어있는지 살짝 보여주시면 좋을것 같습니다.

4. 실행 코드

마지막에서 두번째 셀

chain = GraphCypherQAChain.from_llm(
    llm, graph=graph, verbose=True, qa_prompt=CYPHER_QA_PROMPT, cypher_prompt=CYPHER_GENERATION_PROMPT,
    allow_dangerous_requests = True
)

마지막에서 두 번째 셀의 from_llm 부분은 현재 방식이 오래된 것 같습니다.

예전(3~4개월 전) 기준으로는 LangChain이 해당 클래스를 업데이트하지 않았던 것으로 기억하는데, 최신 상태에서도 그대로인지 살짝 확인해보시면 좋을 것 같습니다.

완전 초안이고, 생각나는 대로 마구잡이로 적어본 내용이라 가볍게 참고만 해주시면 좋겠습니다! 고생하셨습니다!

상세한 리뷰 정말 감사드립니다🥰 다음번 커밋에 피드백주신 바를 적극 반영해 보도록 하겠습니다! 정말 감사합니다 (_ _)

@dancing-with-coffee
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저도 코드 돌려보고 정리해서 적어봅니다!

1. Overview

  • 저랑 비슷한 주제인데, 구현 방식이 아예 달라서 좋은 것 같습니다! 다행히 제가 이걸 먼저 못보고(?) 만들었는데 neo4j랑 docker를 사용해서 GraphDB를 구축하고 만드는 점이 좋았습니다. 그리고 질의도 아예 GraphDB에서 쓰는 Cypher를 사용한 점도 좋았습니다.
  • 다만, Academic Search System 답게 논문을 추천하는 방향으로 예시가 발전되면 좋지 않을까 합니다. (가능한지는 잘 몰라서.. 그냥 의견으로 받아들여주시면 좋을 것 같아요)

2. 데이터

  • 저도 부족한 부분이지만, 데이터에 대한 설명이 더 있으면 좋을 것 같습니다. 받아놓은 json이 어떤 정보를 담고 있는지에 대한 metadata는 알지만 구체적으로 어떤 데이터인지 몰라서 사용에 고민이 될 것 같아요.
  • 예를 들면, 저는 arXiv에 있는 논문을 쓰는데 그런 json 파일인지 아니면 미리 정제해놓은 파일인지 추가가 되면 좋을 것 같습니다!

3. GraphRAG 구현

  • GraphRAG가 어떻게 구현되는지 설명이 추가되면 좋겠습니다.
  • neo4j의 Cypher를 저도 잘 모르고, 사용하는 사람도 모르니까 Cypher의 사용법이나 기초 문법(?) 같은 설명도 있으면 좋을 것 같아요.
  • 지금 구현은 LangGraph를 안 사용하는 것 같은데, 추후에 Agent로 만드실 예정인지도 궁금합니다!

짧은 의견이지만, 가능하고 필요하다고 생각되는 파트만 적용해주시면 될 것 같습니다!
다음주에 완성되면 저도 neo4j로도 비교해서 돌려봐야겠습니다.. 제꺼는 너무 느려서요ㅠㅠ

@YellowGangneng
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@syshin0116 리뷰 최대한 반영해 보았습니다 (링크 추가나 아주 조금이지만 단점을 언급한 부분 등..?)
그리고 from_llm 부분은 큰 변화가 없어서 그냥 그대로 사용하였습니다! 리뷰에 많은 도움을 얻었습니다 감사합니다 (_ _)

@dancing-with-coffee 피드백주신 대로 데이터에 대한 설명 최대한 상세히 첨부하려 노력했습니다! 그리고 저도 논문을 추천하는 방향으로 가고 싶어 Langgraph를 활용해 보았는데... 성능이 영 안 좋아서 그대로 반영하는 게 맞을지 모르겠네요... ; - ;
아무튼 덕분에 작업물 퀄리티를 많이 높일 수 있었던 것 같습니다! 감사합니다(_ _)

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@syshin0116 syshin0116 left a comment

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[Todo]

아직 코드는 제대로 돌려보지 못해서, 외형적인 부분만 먼저 작성했습니다. 코드 실행 동작 확인 부분은 확인후에 체크하겠습니다!

[Review Checklist]

  • Review OS:

    • Windows / Mac / Linux (Mac)
  • Template Rule 준수 여부:

    • Template Rule 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • Table of Contents 링크 확인:

    • Table of Contents의 링크가 원활하게 동작하는지 확인하였는가? (Check 표기)

Let's make the Academic Search System이 작동안합니다! let-s 에서 - 하나 빼니 작동하네요ㅎㅎ

[Let's make the Academic Search System](#lets-make-the-academic-search-system)

  • 이미지 파일명 검토:
    • 이미지가 포함되어 있다면, 이미지의 파일명이 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)

이미지 파일명이 10-academic-search-system 시작하는데 07-academic-search-system 로 수정이 필요해 보입니다!

  • 최신 import 방식 사용 여부:

    • import 구문이 예전 legacy 방식이 아닌 최신 버전을 따르는가? (Check 표기)
  • 코드 동작 확인:

    • 모든 코드가 오류 없이 동작하는가? (Check 표기)
    • Warning 발생 시 코멘트에 적어주세요.
  • 제출 파일 확인:

    • 꼭 필요한 파일들만 제출되었는가?
      • 튜토리얼 외 설정 파일이나 다른 분이 작업한 파일이 포함되었는지 Files Changed에서 확인 부탁드립니다. (Check 표기)
  • 기타 의견:

Environement Setup

image

NEO4J_URL 대신 NEO4J_URI을 공통적으로 사용하기로 했습니다. 통일해주시면 좋을것 같습니다!

# Set environment variables
from langchain_opentutorial import set_env

set_env(
    {
        "OPENAI_API_KEY": "",
        "LANGCHAIN_API_KEY": "",
        "LANGCHAIN_TRACING_V2": "true",
        "LANGCHAIN_ENDPOINT": "https://api.smith.langchain.com",
        "LANGCHAIN_PROJECT": "Academic Search System", 
    }
)

이부분에 "NEO4J_URI", "NEO4J_USERNAME", "NEO4J_PASSWORD" 추가해주면 조금 더 친절한 튜토리얼이 될것 같아요!

docker-compose.yml 부분

```yaml : 3중 backtick 뒤에 yaml 명시해주면 색깔 들어가서 좀 더 보기 편해집니다!ㅎㅎ

LangGraph

그래프를 시각화해서 한번 보여주면 좋을것 같습니다

from IPython.display import Image, display
from langchain_core.runnables.graph import CurveStyle, MermaidDrawMethod, NodeStyles

# Visualize the compiled StateGraph as a Mermaid diagram
display(
    Image(
        app.get_graph().draw_mermaid_png(
            draw_method=MermaidDrawMethod.API,
        )
    )
)

고생하셨습니다!! 유용한 튜토리얼이어서, 조만간 참고해서 논문 검색해주는 서비스 만들어보고싶네요.
Ta-da! 같은 텐션 재밋었습니다ㅋㅋㅋㅋ

@YellowGangneng
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[Todo]

아직 코드는 제대로 돌려보지 못해서, 외형적인 부분만 먼저 작성했습니다. 코드 실행 동작 확인 부분은 확인후에 체크하겠습니다!

[Review Checklist]

  • Review OS:

    • Windows / Mac / Linux (Mac)
  • Template Rule 준수 여부:

    • Template Rule 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • Table of Contents 링크 확인:

    • Table of Contents의 링크가 원활하게 동작하는지 확인하였는가? (Check 표기)

Let's make the Academic Search System이 작동안합니다! let-s 에서 - 하나 빼니 작동하네요ㅎㅎ
[Let's make the Academic Search System](#lets-make-the-academic-search-system)

  • 이미지 파일명 검토:

    • 이미지가 포함되어 있다면, 이미지의 파일명이 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)

이미지 파일명이 10-academic-search-system 시작하는데 07-academic-search-system 로 수정이 필요해 보입니다!

  • 최신 import 방식 사용 여부:

    • import 구문이 예전 legacy 방식이 아닌 최신 버전을 따르는가? (Check 표기)
  • 코드 동작 확인:

    • 모든 코드가 오류 없이 동작하는가? (Check 표기)
    • Warning 발생 시 코멘트에 적어주세요.
  • 제출 파일 확인:

    • 꼭 필요한 파일들만 제출되었는가?

      • 튜토리얼 외 설정 파일이나 다른 분이 작업한 파일이 포함되었는지 Files Changed에서 확인 부탁드립니다. (Check 표기)
  • 기타 의견:

Environement Setup

image `NEO4J_URL` 대신 `NEO4J_URI`을 공통적으로 사용하기로 했습니다. 통일해주시면 좋을것 같습니다!
# Set environment variables
from langchain_opentutorial import set_env

set_env(
    {
        "OPENAI_API_KEY": "",
        "LANGCHAIN_API_KEY": "",
        "LANGCHAIN_TRACING_V2": "true",
        "LANGCHAIN_ENDPOINT": "https://api.smith.langchain.com",
        "LANGCHAIN_PROJECT": "Academic Search System", 
    }
)

이부분에 "NEO4J_URI", "NEO4J_USERNAME", "NEO4J_PASSWORD" 추가해주면 조금 더 친절한 튜토리얼이 될것 같아요!

docker-compose.yml 부분

```yaml : 3중 backtick 뒤에 yaml 명시해주면 색깔 들어가서 좀 더 보기 편해집니다!ㅎㅎ

LangGraph

그래프를 시각화해서 한번 보여주면 좋을것 같습니다

from IPython.display import Image, display
from langchain_core.runnables.graph import CurveStyle, MermaidDrawMethod, NodeStyles

# Visualize the compiled StateGraph as a Mermaid diagram
display(
    Image(
        app.get_graph().draw_mermaid_png(
            draw_method=MermaidDrawMethod.API,
        )
    )
)

고생하셨습니다!! 유용한 튜토리얼이어서, 조만간 참고해서 논문 검색해주는 서비스 만들어보고싶네요. Ta-da! 같은 텐션 재밋었습니다ㅋㅋㅋㅋ

피드백 반영하여 수정하였습니다!!! ㅎㅎㅎ 상세한 피드백 정말 감사드립니다🙇‍♂️

@syshin0116
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syshin0116 commented Jan 17, 2025

[Review Checklist]

  • Review OS:

    • Windows / Mac / Linux (�Mac)
  • Template Rule 준수 여부:

    • Template Rule 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • Table of Contents 링크 확인:

    • Table of Contents의 링크가 원활하게 동작하는지 확인하였는가? (Check 표기)
  • 이미지 파일명 검토:

    • 이미지가 포함되어 있다면, 이미지의 파일명이 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • 최신 import 방식 사용 여부:

    • import 구문이 예전 legacy 방식이 아닌 최신 버전을 따르는가? (Check 표기)
  • 코드 동작 확인:

    • 모든 코드가 오류 없이 동작하는가? (Check 표기)
    • Warning 발생 시 코멘트에 적어주세요.

Environment Setup

langgraph 뒤에 "," 쉼표가 빠졌습니다

# Install required packages
from langchain_opentutorial import package

package.install(
    [
        "langchain-neo4j", 
        "langchain",
        "langchain_openai",
        "langchain_core",
        "langgraph"
        "pyalex",
    ],
    verbose=False,
    upgrade=False,
)
  • 제출 파일 확인:

    • 꼭 필요한 파일들만 제출되었는가?
      • 튜토리얼 외 설정 파일이나 다른 분이 작업한 파일이 포함되었는지 Files Changed에서 확인 부탁드립니다. (Check 표기)
  • 기타 의견:


def make_file

위에 json_path에 경로 넣고 끝에 "/'를 넣지 않는 경우엔 의도하신대로 작동하지 않는것 같습니다.
아래과 같이 수정하면 개선 가능할것 같아요

#수정 전
file = json_path + name.replace(" ", "_") + "_" + entity + ".json"

#수정 후
file = os.path.join(json_path, f"{name.replace(' ', '_')}_{entity}.json")

def relationship_vector_search_tool

사소하지만 "relathionship" 오타 발견했습니다ㅎㅎ

image

이외의 코드 실행은 문제 없었습니다.

리뷰하며 많이 배워갑니다ㅎㅎ고생 많으셨습니다!!

@YellowGangneng
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Contributor Author

[Review Checklist]

  • Review OS:

    • Windows / Mac / Linux (�Mac)
  • Template Rule 준수 여부:

    • Template Rule 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • Table of Contents 링크 확인:

    • Table of Contents의 링크가 원활하게 동작하는지 확인하였는가? (Check 표기)
  • 이미지 파일명 검토:

    • 이미지가 포함되어 있다면, 이미지의 파일명이 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • 최신 import 방식 사용 여부:

    • import 구문이 예전 legacy 방식이 아닌 최신 버전을 따르는가? (Check 표기)
  • 코드 동작 확인:

    • 모든 코드가 오류 없이 동작하는가? (Check 표기)
    • Warning 발생 시 코멘트에 적어주세요.

Environment Setup

langgraph 뒤에 "," 쉼표가 빠졌습니다

# Install required packages
from langchain_opentutorial import package

package.install(
    [
        "langchain-neo4j", 
        "langchain",
        "langchain_openai",
        "langchain_core",
        "langgraph"
        "pyalex",
    ],
    verbose=False,
    upgrade=False,
)
  • 제출 파일 확인:

    • 꼭 필요한 파일들만 제출되었는가?

      • 튜토리얼 외 설정 파일이나 다른 분이 작업한 파일이 포함되었는지 Files Changed에서 확인 부탁드립니다. (Check 표기)
  • 기타 의견:

def make_file

위에 json_path에 경로 넣고 끝에 "/'를 넣지 않는 경우엔 의도하신대로 작동하지 않는것 같습니다. 아래과 같이 수정하면 개선 가능할것 같아요

#수정 전
file = json_path + name.replace(" ", "_") + "_" + entity + ".json"

#수정 후
file = os.path.join(json_path, f"{name.replace(' ', '_')}_{entity}.json")

def relationship_vector_search_tool

사소하지만 "relathionship" 오타 발견했습니다ㅎㅎ

image 이외의 코드 실행은 문제 없었습니다.

리뷰하며 많이 배워갑니다ㅎㅎ고생 많으셨습니다!!

피드백 반영하였습니다 (_ _ ) 정말 감사합니다!

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@syshin0116 syshin0116 left a comment

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[Review Checklist]

  • Review OS:

    • Windows / Mac / Linux (Mac)
  • Template Rule 준수 여부:

    • Template Rule 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • Table of Contents 링크 확인:

    • Table of Contents의 링크가 원활하게 동작하는지 확인하였는가? (Check 표기)
  • 이미지 파일명 검토:

    • 이미지가 포함되어 있다면, 이미지의 파일명이 가이드를 준수하였는가? (Check 표기)
  • 최신 import 방식 사용 여부:

    • import 구문이 예전 legacy 방식이 아닌 최신 버전을 따르는가? (Check 표기)
  • 코드 동작 확인:

    • 모든 코드가 오류 없이 동작하는가? (Check 표기)
    • Warning 발생 시 코멘트에 적어주세요.
  • 제출 파일 확인:

    • 꼭 필요한 파일들만 제출되었는가?
      • 튜토리얼 외 설정 파일이나 다른 분이 작업한 파일이 포함되었는지 Files Changed에서 확인 부탁드립니다. (Check 표기)
  • 기타 의견:
    내용 확인했습니다 고생하셨습니다!

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@dancing-with-coffee dancing-with-coffee left a comment

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🖥️ OS: Mac/Linux(docker)

✅ Checklist

  • Template: Tutorials follows the required template.
  • Table of Contents(TOC) Links: All Table of Contents links work. ((Yes/No)
  • Image: Image filenames follow guidelines.
  • Imports: All import statements use the latest versions. Ensure "langchain-teddynote" is not used.
  • Code Execution: Code runs without errors.
  • Comments: {Write freely, 한국어 기술 가능}

@syshin0116 님이 자세하게 모두 수정해주셔서, 최종 commit version에서 모두 정상 동작합니다! 다만, teddy님 설치 영상에도 linux 파트가 없고 대부분 이 튜토리얼을 실행하시는 분들이 docker, docker-compose 같은건 잘 모를것 같아서.. 추가적인 튜토리얼이 따로 있어야할 것 같아요!

neo4j 뿐만 아니라, 다른 튜토리얼에도 있을 것 같아서 docker를 사용하는 다른 튜토리얼 제작자 분들하고 같이 논의해보시면 좋을 것 같습니다!
저는 docker, docker-compose를 써봤지만 거기서 poetry 세팅하고 수정하는데에도 시간이 꽤 걸렸거든요ㅠㅠ

진짜 환경 세팅하시는데 힘드셨을 것 같습니다..ㅎㅎ 고생 많으셨어요!

@teddylee777 teddylee777 merged commit 129fc69 into LangChain-OpenTutorial:main Jan 19, 2025
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